一、細菌性爛尾、爛鰭症：由細菌引起的爛尾、爛鰭症傳染性極高，從鰭條開始，繼而身體腐爛至死。 這種爛鰭症有兩種病徵，第一種由鰭邊開始腐爛，再向內伸展，第二種由鰭中央部分開始，向四面八方蔓延。 患處變白色，最後脫落。 金魚運送或產卵後身體抵抗力會減弱，此時最易感染此疾病。 病魚一經發現，必須立即隔離，施以抗生素或叮啶黃等藥劑來治療病魚。 爛鰭症的病徵出現較慢時，治療法是更換部分缸水，清洗過濾器和添加少許食鹽入缸內，並停止餵食數天。 食鹽療法的作用是增加水的比重，改變水中的滲透壓，透過滲透作用的變化來殺死細菌和其他的病原體。 也可直接使用市售的Sera治細菌治生蟲劑、美利堅滅菌靈、女王鯨專治金魚疾病劑、女王鯨治細菌劑及AZ00治細菌劑來治療。
二、細菌性鰓病：感染細菌性鰓病的金魚，最初的病徵是食慾不振，常停在水面下，且呼吸急促，若是揭起鰓蓋後緣，會見到呈白色的殘缺鍶絲。 尤其在擁擠的魚缸中，當水質變壞時，金魚最易感染此症，且傳染性很高，因此須隔離病魚。 治療此病的方法及藥劑和細菌性爛尾、爛鰭症相同，但需加鹽到水中（每一百公升水量加兩公克食鹽），以減少金魚體液由腐爛的鍶絲流失到魚體外，導致金魚脫水而死。 真菌也會引致爛鍶，因此要改善水質，這樣才可控制病情。 過濾器能清除懸浮微粒，防止細菌及真菌滋長，保持缸水清潔，因此加強過濾系統能夠防止鍶病的發生。
三、立鱗病：在水族箱內，常可發現金魚因罹病而導致鱗片突出並脫落。 大部分病魚的鱗片幾乎會全部立起來，僅有少數的病魚出現部分立鱗現象，如果磨擦病魚的體表，原已鬆動的鱗片就會紛紛脫落。 引起此病的病原體目前尚不清楚，但多在冬季和夏季水溫低時發生。 此病的死亡率很高，若是及早發現，施以抗生素治療，如美利堅滅菌靈及AZ00治細菌劑也可治愈病魚。 此病無傳染性，但照顧病魚卻是相當麻煩。
四、紅點病：病魚的體側及腹部均會出現明顯的紅斑點，此為其最大的特徵。 倘若水中細菌大量增加，金魚皮膚會受到破壞，因而充滿血液，此時應立即更換缸水，便可不藥而愈。 嚴懲的病魚則需隔離，施以抗生素治療。
五、徵菌性疾病：金魚是變溫動物，體溫是隨著水溫而改變。 當冬季水溫降低，魚體抵抗力亦隨之減弱，因此受徵菌感染的情形很普遍。 患病的金魚身體會長出白色棉花狀物體，尤其是頭上的肉瘤最易受感染。 應盡量保持缸水清潔，用甲烯藍染液塗抹患處可加快痊癒，也可施孔雀綠溶液治療法，把病魚浸泡於一百公升水含0.2公克的藥物溶液中，直至其痊癒為止，亦可直接用Sera治徵菌治生蟲劑、女王鯨治徵菌劑、AZ00治徵菌劑治療處理。
六、白點病：這種病是由原生動物所引起，病原體名為白點蟲，它會深入皮膚的細胞，進行無性繁殖，形成白色的小點狀胞囊。 患有此病的金魚全身滿佈白點，每個白點胞囊內含有許多幼小白點蟲，白點蟲吸取魚體組織的營養而長大並增加數目，後來破囊而出，游到水中，再返回魚體上侵襲皮膚，形成更多的小白點。 在患病初期，病魚會用身體磨擦硬物，希望藉此清除身上討厭的病原體，若不立刻治療，病魚身體會迅速受嚴重破壞而死亡。 當白點蟲侵入魚體後，藥物治療不能奏效，只有當小白點蟲在魚體繁殖後，新個體游到水中，藥劑才能殺死它們。 治療法為使用百分之0.01濃度的孔雀綠溶液，把病魚浸泡多天，直至小白點完全消失，孔雀綠溶液的毒性很強，不可使用過量，否則金魚亦會被毒死，或使用市售的Sera治白點劑、美利堅立滅白點、女王鯨治白點劑、AZ00治外寄生蟲劑治療。
七、魚虱病：魚蝨是一種寄生性的甲殼類動物，大部分時間寄生在金魚身體上，只有幼蟲和成蟲產卵期才到水中流動。 魚蝨腹面處有兩個吸盤，用來吸附在金魚身體上。 口部呈針狀，用來刺進魚體，吸取血液，使患處出血變紅，因而易受細菌感染。 除非金魚受大量的魚蝨侵襲，否則不易因此病而死亡。 有機磷的殺蟲齊是魚蝨的特效藥，但對金魚也有害處，最好的方法是用尖鉗子把魚蝨逐一除去，或用Sera魚池治生蟲劑、美利堅治生蟲劑、美利堅去吸蟲特效錠、女王鯨治寄生蟲劑、AZ00治外寄生蟲劑治療。
八、吸蟲性疾病：侵襲金魚皮膚、鍶和其它器官的吸蟲有很多種，較普通的有皮膚性吸蟲和鍶吸蟲兩種。 當金魚受上述吸蟲侵襲，身體會痙攣，食慾降低，游動呆滯。 鰓部若受嚴重感染，金魚會因不能吸取氧氣而窒息。 成魚和幼魚的治療法有異，成魚可放進稀福馬林溶液三十分鐘，幼魚以濃食鹽溶液代替福馬林溶液，寄生吸蟲即會被殺死或受刺激而脫離魚體，或以市售Sera治徵菌性治生蟲劑、美利堅治生蟲劑及去吸蟲特效錠、女王鯨治寄生蟲劑、AZ00治外寄生蟲劑治療。
九、缺氧病：金魚是吸取水澡溶氧來呼吸生存的，每一公升水應有五毫克溶氧量，不然金魚會因吸不到充足氧氣而窒息，輕微的缺氧會造成浮頭，金魚浮到水面上呼吸，所以應用打氣泵打氣入水中，以確保金魚得到充足的氧氣。
十、魚鰾病：罹患此病的金魚無法維持其軀體的平衡，有時會有倒栽蔥似的翻跟斗，最後不是沉在水底，就是浮在水面上。 短身腹部肥大的金魚最常患此病，病魚也有正常食慾，能生存很長時間，但失去觀賞價值。 這種病無法治療，防治的方法就是水溫不宜急劇升降。
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